L'himne del club és peculiar i amb una lletra on la principal
intenció és unir el que es considera el més important en un club de futbol, la bona harmonia entre jugadors i afició
Navata!, Navata!,
visca el Navata Futbol Club!
Som l'equip més ben parit
i de tot l'Empordà,
per això sempre el seguim
vagi on vagi el nostre equip.
Uns jugant d'altres cantant,
molta glòria portarem,
per això sempre cridarem:
Navata!, Navata!,
visca el Navata Futbol Club!
Lletra i música:
Jaume Noguer
Albert Cuevas
Agustí Gambarte
Pep Ramis
